Ć»ąűŇůÔş

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Vers un diagnostic plus rapide

Des chercheurs de l’UniversitĂ© Ć»ąűŇůÔş ont mis au point une mĂ©thode rĂ©volutionnaire pour l’analyse gĂ©nomique massivement parallèle de longues molĂ©cules d’ADN
±ĘłÜ˛ú±ôľ±Ă©: 5 August 2014

Des chercheurs du Centre d’innovation GĂ©nome QuĂ©bec et UniversitĂ© Ć»ąűŇůÔş ont rĂ©alisĂ© une percĂ©e technologique qui pourrait permettre un diagnostic plus rapide du cancer et de divers problèmes prĂ©nataux.

Cette importante dĂ©couverte, qui a fait l’objet d’un article publiĂ© en ligne cette semaine dans la revue scientifiqueĚýProceedings of the National Academy of Sciences, est un nouvel outil conçu par les professeurs SabrinaĚýLeslie et Walte°ůĚýReisner, du DĂ©partement de physique de l’UniversitĂ©ĚýĆ»ąűŇůÔş, et leur collaborateur, le D°ůĚýRobĚýSladek, du Centre d’innovation GĂ©nome QuĂ©bec. Il permet aux chercheurs d’introduire de longs brins d’ADN dans une chambre d’imagerie nanomĂ©trique accordable de manière Ă  prĂ©server leur identitĂ© structurelle, dans des conditions semblables Ă  celles auxquelles ils sont exposĂ©s dans le corps humain.

Ce nouvel outil reposant sur une mĂ©thode appelĂ©e «Ěýconfinement induit par une lentille convexeĚý» (Convex Lens-Induced ConfinementĚý[CLIC]) permettra aux chercheurs de cartographier rapidement de grands gĂ©nomes tout en identifiant clairement des sĂ©quences gĂ©nĂ©tiques prĂ©cises dans des cellules individuelles avec une rĂ©solution de l’ordre d’une seule molĂ©cule, processus essentiel au diagnostic de maladies telles que le cancer.

Le dispositif CLIC peut ĂŞtre placĂ© sur un microscope Ă  fluorescence inversĂ© standard, comme ceux que les chercheurs utilisent dans les laboratoires universitaires. L’aspect innovant de ce dispositif tient au fait qu’il permet de placer les brins d’ADN dans la chambre d’imagerieĚýpar le haut, une technique qui prĂ©serve leur intĂ©gritĂ©. Avec les outils d’analyse gĂ©nomique existants, les chercheurs doivent introduire les brins d’ADN dans des nanocanaux dans la chambre d’imagerie par le cĂ´tĂ©, sous pression, une technique qui rĂ©duit les molĂ©cules d’ADN en petits fragments. Il devient alors très difficile de reconstruire le gĂ©nome.

«ĚýC’est un peu comme si on introduisait de nombreux spaghettis trop cuits dans de longs tubes Ă©troits sans les brise°ůĚý», explique la professeureĚýLeslie, dĂ©crivant le mode d’utilisation du dispositif CLIC. «ĚýAprès avoir Ă©tĂ© pressĂ©s dĂ©licatement dans des nanocanaux Ă  partir d’un bain nanomĂ©trique situĂ© au-dessus, les longs brins d’ADN deviennent rigides, ce qui nous permet de cartographier les positions le long des brins d’ADN Ă©tirĂ©s uniformĂ©ment et immobilisĂ©s. Les diagnostics peuvent ainsi ĂŞtre posĂ©s rapidement, une cellule Ă  la fois, ce qui est crucial pour diagnostiquer de nombreuses affections prĂ©natales, ainsi que le cancer Ă  ses dĂ©buts.Ěý»

«ĚýAvec les mĂ©thodes d’analyse gĂ©nomique actuelles, il nous faut gĂ©nĂ©ralement disposer de l’équivalent du matĂ©riel gĂ©nomique de dizaines de milliers de cellules pour obtenir l’information dont nous avons besoin, mais cette nouvelle approche fonctionne avec des cellules individuellesĚý», affirme le DrĚýRobĚýSladek du Centre d’innovation GĂ©nome QuĂ©bec. «ĚýLe dispositif CLIC permettra aux chercheurs d’éviter de devoir raccorder les cartes de gĂ©nomes entiers comme ils le font actuellement, et fera de l’analyse gĂ©nomique un processus beaucoup plus simple et efficient.Ěý»

«ĚýLa nanophysique a beaucoup Ă  offrir Ă  la biomĂ©decine et Ă  la science diagnostiqueĚý», ajoute la professeureĚýLeslie. «ĚýGrâce au dispositif CLIC, le rĂ©gime nanomĂ©trique a gagnĂ© les tables de laboratoire, et la gĂ©nomique n’est que le dĂ©but.Ěý»

Version intĂ©grale de l’articleĚýConvex Lens-Induced Nanoscale Templating, pa°ůĚýSabrinaĚýR.ĚýLeslieĚýetĚýcoll., publiĂ© dans la revue scientifiqueĚýProceedings of the NationalĚýAcademy of SciencesĚý:Ěý.

Cette Ă©tude a Ă©tĂ© financĂ©e par le Conseil de recherchesĚýen sciences naturelles et en gĂ©nie du Canada, les Instituts de recherche en ˛ő˛ą˛ÔłŮĂ© du Canada et la Fondation canadienne pour l’innovation.

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